Uma vez que existe um padrão claro de herança genética de LHON, as pessoas com um familiar na linhagem materna que possua uma mutação de LHON devem supor que qualquer perda de visão central súbita e indolor que apresentem seja provavelmente provocada por LHON. No entanto, ter a mutação de LHON não significa que um portador de LHON vá perder a visão central; a maioria dos portadores de uma mutação de LHON não perde a visão central. Apenas cerca de 50% dos homens portadores de uma mutação de LHON perderão a visão ao longo da sua vida; o mesmo ocorrerá a apenas cerca de 10% das mulheres.
A mutação de LHON mais comum é a mutação 11778, sendo responsável por cerca de 60% de todos os casos de LHON. A maioria dos restantes casos de LHON são provocados pela mutação 14484 ou pela mutação 3460, enquanto cerca de 5-10% dos casos são provocados por uma de várias mutações muito raras.
As pessoas que não têm conhecimento de quaisquer familiares com LHON são apanhadas de surpresa quando subitamente perdem a visão central. Uma vez que a LHON é tão rara, a comunidade médica normalmente suspeita, testa e trata outras causas de perda de visão súbita. Poderá ser realizada uma RM para descartar um tumor cerebral. Uma vez que a perda de visão normalmente começa apenas num olho, é muitas vezes realizado um diagnóstico provisório de neurite ótica, sendo frequentemente prescrito um tratamento com esteroides para 3 ou 5 dias. Quando a visão não melhora e o segundo olho também começa a perder a visão, poderá haver mais testes, tais como um Resposta Visual Evocada (RVE) e uma Punção Lombar (ou Punção Espinhal) para descartar outras causas possíveis de perda de visão súbita e bilateral.